소수성 단위가 묻혀 있는 코어에 모이도록 그리드를 가로질러 잔류물 체인을 구부리고 에너지를 입증된 최소 수준으로 압축합니다.
단백질은 2D 격자에서 소수성(H) 및 극성(P) 잔기의 사슬로 모델링됩니다. 결합되지 않고 인접해 있는 소수성 이웃은 에너지를 낮춥니다. 당신의 목표는 H 잔류물이 컴팩트한 코어를 형성하고 최적의 에너지를 얻을 수 있도록 체인을 접는 것입니다.
Helixfold는 단백질 접힘의 고전적인 소수성-극 격자 모델을 기반으로 구축되어 접힌 부분에 대한 검색을 퍼즐로 바꿉니다.
격자 위에 소수성 잔기와 극성 잔기로 된 사슬을 놓고, 결합하지 않은 H-H 접촉이 에너지를 낮추는 것은 단백질 접힘의 HP 모델이다.
알려진 모양과의 유사성이 아니라 에너지를 직접 채점하는 것이 독창적인 접근이다.
에너지가 알맞은 목표인 이유는 자연이 최소화하는 것이 그것이기 때문이다. 소수성 효과는 비극성 잔기를 안쪽으로 몰아넣으며, 그 밖에는 거의 아무것도 담지 않은 모델도 실제 단백질이 지닌 촘촘한 중심부를 재현한다. HP 모델이 교육과 연구 도구로 살아남은 이유다.
Helixfold는 단백질 접힘의 고전적인 소수성 극성 격자 모델을 기반으로 구축되어 최소 에너지 구조에 대한 검색을 촉각 퍼즐로 전환합니다. 세 가지 체인 길이와 일일 플러스 연습 모드를 갖춘 독창적인 무료 브라우저 게임입니다.